Cet édifice de 40 mètres de long sur 16 de large a la particularité d'être construit sur le roc et sans transept. Une longue nef centrale et deux nefs latérales formant les bas-côtés lui donnent une ligne svelte, à l'image de son clocher d'ardoises qui s'élance droit dans le ciel.
D'origine Romane, et déjà mentionnée en 1368, on y retrouve quelques traces de cette époque au fond du choeur, dont quatre gros murs et des contreforts, grossièrement construits avec de la pierre à blé. L'église a été de nombreuses fois remaniée au cours des siècles, avec plus ou moins de réussite, en 1450 (date figurant sur une sablière à droite du choeur), en 1710, en 1842, en 1863, en 1932 , et enfin en 1974.
L'église de Béganne est sur la commune le témoignage vivant du passé, avec l'omniprésence d'une classe issue de la noblesse Française. On y trouvait cinq enfeus :
- celui de l'Étier dans la chapelle Nord.
- celui de Léhellec dans le choeur
- celui de la Soualaye, de Trégouet, de Brécéan, dans la chapelle Sud.